Types de variables et opérations R

a. Exécution d’une instruction

C’est à la suite du prompt ">" que les instructions R sont évaluées ou que les scripts sont exécutés. Cette console est interactive et, comme la plupart des interpréteurs modernes, utilise la boucle d’évaluation REPL pour Read-Evaluate-Print-Loop, autrement dit lorsqu’une instruction est saisie à la suite du prompt et que l’on tape la touche [Entrée], l’interpréteur fait alors son travail :

Plus explicitement :

Cette console R est comme une puissante calculatrice, l’instruction peut être une opération simple comme dans l’illustration précédente ou contenir l’invocation de fonctions ou d’expressions ou de manière générale d’objets plus complexes.

On peut rappeler une instruction passée avec les touches directionnelles haut et bas du clavier. Comme l’illustre la capture d’écran suivante, en appuyant deux fois sur la touche directionnelle Haut du clavier on retrouve la première opération :

R a réservé un objet spécial, chargé de contenir le dernier résultat affiché...

a. Créer des objets numériques

Ils incluent aussi bien les entiers naturels que les nombres réels en général. Pour distinguer les objets numériques des autres types, on peut utiliser class() ou mode() pour les identifier :

Comme on peut le voir, tout nombre appartient par défaut à la classe des numériques et est encodé comme un nombre à virgule flottante dit double.

Pour s’en rendre compte, on utilise la fonction typeof() ou storage.mode() qui renvoie le type spécifique de l’objet :

Ou utilisera la fonction de test is.double() (on a naturellement as.double() pour coercer tout objet en double si sa structure le permet) :

Il est également permis d’utiliser la notation scientifique des réels en général avec la lettre ’e’, par exemple :

Toutefois, on peut créer des entiers naturels en faisant précéder le nombre par la lettre L ou en utilisant la fonction de coercition as.integer() :

On constate également que l’on dispose de la fonction is.integer() pour tester si un nombre est de type entier naturel.

b. Créer des nombres complexes

R gère également les nombres complexes. L’essentiel des opérateurs et fonctions qui s’appliquent aux réels est applicable aux complexes aussi. Pour qu’un nombre complexe se crée, il faut ajouter à un nombre réel une partie complexe dite imaginaire. Cette partie imaginaire est un réel suivi de la lettre i :

Comme on peut le voir, les nombres complexes sont encodés différemment. Contrairement aux autres qui sont des numeric, ils sont de la classe complex, et stockés comme tels.

On peut coercer tout autre nombre ou nombre entre...

a. Création des dates

Pour manipuler les dates, la classe la plus simple est Date. Son constructeur, la fonction as.Date(), prend en argument une date représentée par une chaîne de caractères obéissant à un certain format. Par défaut, seul le format standard (ISO 8601) est reconnu année/mois/jours ou année-mois-jours :

Toutefois, on peut fournir une date de format quelconque tout en prenant soin d’en spécifier le formatage...

a. Télécharger et installer un package

Cas d’un package sur CRAN

CRAN (Comprehensive R Archive Network) est le dépôt officiel et le plus populaire des packages R, on a bien entendu également Bioconductor, mais aussi MRAN (Microsoft R Application Network), qui offre un outil de recherche de package sur CRAN) plus récent depuis Microsoft R Open. On y trouve plus de 10 000 packages à ce jour, téléchargeables gratuitement avec la fonction install.packages(). Voici un exemple d’installation de package depuis CRAN/MRAN.

Cette fonction peut prendre en charge le téléchargement et l’installation de plusieurs packages en même temps dont les noms doivent être fournis sous forme de vecteur c() :

Pour ne pas surcharger le serveur, CRAN dispose de plusieurs miroirs dont il est possible d’obtenir la liste avec getCRANmirrors() dont voici un extrait des URL par ville.

On peut ensuite choisir le miroir dont on est le plus proche pour télécharger des packages (c’est vivement recommandé)....